Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg6P61406 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg6P61406 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg6P61406 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg6P61406 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms