Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms