Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1bP61264 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms