Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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