Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms