Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ActbP60710 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ActbP60710 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ActbP60710 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms