Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3eP60229 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms