Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms