Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hps5P59438 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hps5P59438 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms