Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PtpaP58389 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PtpaP58389 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PtpaP58389 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms