Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Dpf3P58269 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Dpf3P58269 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Dpf3P58269 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Dpf3P58269 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Dpf3P58269 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Dpf3P58269 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Dpf3P58269 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Dpf3P58269 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Dpf3P58269 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Dpf3P58269 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Dpf3P58269 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Dpf3P58269 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Dpf3P58269 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dpf3P58269 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Dpf3P58269 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Dpf3P58269 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Dpf3P58269 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dpf3P58269 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dpf3P58269 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dpf3P58269 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dpf3P58269 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dpf3P58269 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dpf3P58269 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dpf3P58269 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dpf3P58269 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dpf3P58269 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dpf3P58269 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dpf3P58269 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dpf3P58269 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dpf3P58269 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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