Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms