Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd38P56528 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd38P56528 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms