Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CartptP56388 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CartptP56388 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CartptP56388 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CartptP56388 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CartptP56388 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CartptP56388 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CartptP56388 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CartptP56388 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CartptP56388 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CartptP56388 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CartptP56388 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CartptP56388 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CartptP56388 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CartptP56388 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CartptP56388 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CartptP56388 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CartptP56388 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CartptP56388 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CartptP56388 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CartptP56388 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CartptP56388 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CartptP56388 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CartptP56388 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CartptP56388 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms