Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms