Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms