Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms