Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms