Protein–RNA interactions for Protein: P51942

Matn1, Cartilage matrix protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn1P51942 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Matn1P51942 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms