Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms