Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Opn1swP51491 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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