Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx3P50481 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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