Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms