Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms