Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms