Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TgfaP48030 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TgfaP48030 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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