Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rplp1P47955 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms