Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccr7P47774 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms