Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms