Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4bP46467 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4bP46467 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms