Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms