Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt1P46096 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Syt1P46096 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt1P46096 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms