Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms