Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx1P43345 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms