Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms