Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms