Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Mmp9P41245 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Mmp9P41245 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Mmp9P41245 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Mmp9P41245 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Mmp9P41245 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Mmp9P41245 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Mmp9P41245 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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