Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CskP41241 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CskP41241 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CskP41241 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms