Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms