Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms