Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd1P40201 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd1P40201 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms