Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik2P39087 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms