Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TtlP38585 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtlP38585 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TtlP38585 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TtlP38585 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TtlP38585 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TtlP38585 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TtlP38585 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TtlP38585 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TtlP38585 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtlP38585 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms