Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig1P37913 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms