Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms