Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6fP35460 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6fP35460 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6fP35460 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms