Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms