Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms