Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms