Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms